可以根据颜色区分，大果紫檀的心材呈桔红，黄色或浅黄。而刺猬紫檀心材呈砖红，或紫红色，常带一些深色的条纹。也可以通过木纹区分，大果紫檀内部的木纹清晰，分布均匀，某些部位可以看到明显的虎皮纹。而且刺猬紫檀内部木纹纹理交错，梢部较直。两个木材的价格差距也较大，大果紫檀的价格大概是刺猬紫檀的三倍，所以相比之下刺猬紫檀的性价比也是很高的。
