蓝藻细胞中光合色素分布在类囊体上，类囊体分布在叶绿体基质和蓝藻细胞中，是单层膜围成的扁平小囊，也称为囊状结构薄膜，沿着叶绿体的长轴平行排列。类囊体膜上含有光合色素和电子传递链组分，“光能向活跃的化学能的转化（光反应）”在此上进行，因此类囊体膜亦称光合膜，脂类中的脂肪酸主要是不饱和脂肪酸（约87%），具有较高的流动性。